MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT73

Total Repeats: 300

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020249	ACC	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020249	TAT	2	6	2189	2194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020249	TAA	2	6	2210	2215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020249	ATTA	2	8	2223	2230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020249	TTA	2	6	2237	2242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020249	ATG	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020249	TTC	2	6	2316	2321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020249	AGGA	2	8	2347	2354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020249	CTTT	2	8	2380	2387	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020249	T	6	6	2395	2400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020249	TA	3	6	2414	2419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020249	TAA	2	6	2444	2449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020249	TA	3	6	2478	2483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020249	TAA	2	6	2574	2579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020249	A	6	6	2586	2591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020249	A	6	6	2601	2606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020249	TA	3	6	2607	2612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020249	A	6	6	2903	2908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020249	ATTT	2	8	2986	2993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020249	TTA	2	6	3014	3019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020249	CA	3	6	3070	3075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020249	TAC	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020249	T	6	6	3196	3201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020249	A	7	7	3284	3290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020249	ACA	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020249	TGC	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020249	TTA	2	6	7067	7072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020249	ATA	2	6	7093	7098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020249	TAC	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020249	A	6	6	7143	7148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020249	TACT	2	8	7208	7215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020249	TTA	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020249	TA	4	8	7317	7324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020249	ATT	2	6	8315	8320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020249	TCTT	2	8	8335	8342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020249	TAA	2	6	8388	8393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020249	A	6	6	8392	8397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020249	TGATT	2	10	8492	8501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020249	AT	4	8	8584	8591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020249	TTAA	2	8	8593	8600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020249	AGA	2	6	8691	8696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020249	TCCT	2	8	8698	8705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020249	GGTT	2	8	8825	8832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020249	GTG	2	6	8920	8925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020249	GTG	2	6	9053	9058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020249	AGT	2	6	9059	9064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020249	A	7	7	10035	10041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020249	TTCT	2	8	10047	10054	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020249	T	6	6	10080	10085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020249	GT	4	8	11555	11562	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020249	T	6	6	11592	11597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020249	ATTTT	2	10	11619	11628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020249	AATA	2	8	11675	11682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020249	GGT	2	6	11720	11725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020249	CATTAT	2	12	13896	13907	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020249	A	6	6	13922	13927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020249	ATT	2	6	13942	13947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020249	ATTT	2	8	13956	13963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020249	TAA	2	6	13970	13975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020249	GTA	2	6	13992	13997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020249	AAG	2	6	14004	14009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020249	TTCC	2	8	14649	14656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020249	CA	4	8	14669	14676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020249	TTG	2	6	14695	14700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020249	ATT	2	6	14714	14719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020249	AAT	2	6	14766	14771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020249	ACT	2	6	14798	14803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020249	TAT	2	6	14849	14854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020249	A	6	6	18381	18386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020249	TTCT	2	8	18392	18399	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020249	AGCT	2	8	18404	18411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020249	T	6	6	18425	18430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020249	A	7	7	19869	19875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020249	A	7	7	20015	20021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020249	T	6	6	20034	20039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020249	TCC	2	6	23903	23908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020249	TATT	2	8	23938	23945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020249	ATTTAT	2	12	23978	23989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020249	ACA	2	6	24003	24008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020249	TGT	2	6	24021	24026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020249	ATT	2	6	24027	24032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020249	T	6	6	24031	24036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020249	A	7	7	24041	24047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020249	AAT	2	6	24067	24072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020249	AT	3	6	24074	24079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020249	T	6	6	24087	24092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020249	T	7	7	24115	24121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020249	T	7	7	24261	24267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020249	A	6	6	25706	25711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020249	CTAG	2	8	25723	25730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020249	AGAA	2	8	25737	25744	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020249	T	6	6	25750	25755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020249	AAG	2	6	25824	25829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020249	ATTA	2	8	25885	25892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020249	ATA	3	9	25909	25917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020249	ATATT	2	10	25923	25932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020249	TAC	2	6	25984	25989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020249	TTC	2	6	26000	26005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020249	A	7	7	26209	26215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020249	A	7	7	26231	26237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020249	TTCT	2	8	26243	26250	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020249	T	6	6	26275	26280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020249	ACTCC	2	10	27376	27385	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_020249	GAG	2	6	27677	27682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020249	GTA	2	6	27745	27750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020249	GCA	2	6	27765	27770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020249	GGA	2	6	27781	27786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020249	AGG	2	6	27822	27827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020249	TGA	2	6	29181	29186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020249	GCT	2	6	29201	29206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020249	TTTA	2	8	29294	29301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020249	TCA	2	6	29327	29332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020249	ATTG	2	8	29381	29388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020249	TTC	2	6	29402	29407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020249	CTC	2	6	29433	29438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_020249	A	6	6	29676	29681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020249	A	6	6	29744	29749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020249	A	6	6	29830	29835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020249	CTA	2	6	29846	29851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020249	TCC	2	6	29992	29997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_020249	T	6	6	30035	30040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020249	TAA	2	6	30044	30049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020249	TAA	2	6	30058	30063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020249	TCC	2	6	30132	30137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_020249	AGC	2	6	30204	30209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020249	TAG	2	6	30231	30236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020249	GGC	2	6	30243	30248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020249	GTT	2	6	30280	30285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020249	AC	3	6	30295	30300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020249	ATT	2	6	31614	31619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020249	AT	3	6	31634	31639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020249	T	6	6	31663	31668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020249	T	6	6	31705	31710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020249	TA	4	8	31739	31746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020249	CTA	2	6	31755	31760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020249	TA	3	6	32735	32740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020249	CT	3	6	32742	32747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020249	CTT	3	9	32829	32837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020249	T	7	7	32844	32850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020249	CAT	2	6	32861	32866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_020249	ATTT	2	8	32950	32957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020249	TGA	2	6	33021	33026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020249	ATA	2	6	33044	33049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020249	AT	3	6	33093	33098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020249	GAATA	2	10	33131	33140	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020249	TAT	2	6	33216	33221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020249	AT	4	8	33470	33477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020249	TA	3	6	33486	33491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020249	CCTA	2	8	33493	33500	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020249	TA	3	6	33499	33504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020249	A	7	7	33564	33570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020249	T	7	7	33623	33629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_020249	T	8	8	39724	39731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_020249	TAATT	2	10	43031	43040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_020249	GAG	2	6	76288	76293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
294	NC_020249	TAT	2	6	77205	77210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_020249	TGT	2	6	77229	77234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_020249	AAT	2	6	77269	77274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_020249	TA	3	6	77286	77291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_020249	AT	3	6	77306	77311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_020249	AGG	2	6	77323	77328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
300	NC_020249	ATGA	2	8	77337	77344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.